probleme avec CSST

Bonjour je voudrais savoir si quelqu'un peut me renseigner.

Le 12 juin j'ai eu un rendez-vous chez le medecin. J'étais à 32 semaines de grossesse et j'avais beaucoup de contractions (Braxton Hicks) genre une vingtaine par jours et mon col avait commencé à s'effacer. Mon medecin à décidé que je devais être en retrait préventif au travail pour éviter d'avoir un accouchement prématuré. Je travaillais beaucoup en alternance debout et assise et mon medecin m'a recommandé d'être au repos complet. Donc ne plus travailler jusqu'à l'accouchement. Elle a remplis une partie du formulaire de CSST me l'a donné et m'a dit de remplir les 2 premieres sections et ensuite d'aller le porter à mon employeur ( ce que j'ai fais la journée même). J'ai donné le tout à ma directrice et m'a dit pas de problème on s'arrange avec ça, je vais envoyer le tout aux ressources humaines. La semaine dernière la fille des ressources humaines me dit qu'il manque des info pour la demande, Il faut une genre "d'enquête du CLSC" et c'est mon medecin qui doit s'en occuper. Faque elle me dit qu'elle va s'en charger et appeller mon medecin et elle me rappelle s'il y a quoi que ce soit. Finalement aujourd'hui un monsieur du CLSC m'appelle pour avoir des info sur le genre de travail que je vais etc.... Il se rend compte que je suis rendu à 37 semaines de grossesse et que la CSST paie jusqu'à 36 semaines. Il me dit qu'il est trop tard pour faire ma demande. Pourtant ma demande à été fait le 12 juin, mais lui il a reçu les papiers seulement le 13 juillet. Il a quand même completé mon dossier, mais il ne pense pas que je vais pouvoir être payé. Je devrais avoir des nouvelles cette semaine, mais ça s'annonce mal d'après lui.
Si jamais ma demande est refusé est-ce que je peux faire quelque chose?
Ce n'est pas de ma faute si le medecin n'a pas suivi la procedure comme il faut et si mon employeur s'en est rendu compte 1 mois plus tard. C'est la premiere fois que je fais une demande donc je ne savais pas commment ça marchait et j'ai suivi les instructions de mon medecin. Si jamais je ne suis pas payé par la CSST est-ce que l'assurance emploi peut faire quelques chose parce que j'ai été 3 semaines sans salaire et ce sans que ce soit de ma faute?

Désolé si mon message est long, mais j'espère que c'est quand même compréhensible.

Merci!!